Kyselina citrónová by sa mala skladovať na chladnom a suchom mieste, mimo dosahu slnečného svetla. V ideálnom prípade by sa mala skladovať vo vzduchotesnej nádobe, aby sa zabránilo prenikaniu vlhkosti. Dôležité je tiež uchovávať ju mimo dosahu detí a domácich zvierat, pretože pre ne môže byť škodlivá.
