V závislosti od toho, ako sa skladuje, môže vydržať rôzne dlho.
Neotvorená fľaša peroxidu vodíka by mala vydržať aspoň tri roky. Akonáhle je fľaša otvorená, peroxid vodíka začne postupne strácať svoju silu. Ak je správne skladovaný (v chlade a suchu, mimo priameho slnka a zdrojov tepla), mal by vydržať asi šesť mesiacov až rok.
Peroxid vodíka je veľmi citlivý na svetlo a teploty, čo znamená, že pokiaľ nie je správne skladovaný, môže rýchlo stratiť svoju účinnosť. Preto by mal byť vždy uchovávaný v tmavej fľaši a na chladnom mieste.
Ak nie je isté, či je peroxid vodíka stále aktívny, možno to overiť jednoduchým testom. Stačí naliať trochu peroxidu vodíka do drezu alebo misky. Ak peroxid vodíka začne bublať a peniť, je stále aktívna. Ak nie, je pravdepodobne neúčinný a mal by byť nahradený novým.